Первыми педагогами, обучавшими школьников музыкально-теоретическим предметам, были преподаватель сольфеджио Юшкова Елена Валентиновна и преподаватель музыкальной литературы Горячева Татьяна Анатольевна. Вступившая в должность заместитель директора по СМШ в 1993 году Дерзаева Ирина Анатольевна подключилась к преподаванию сольфеджио и вплоть до 2005 года работала с начальными классами.

Эти замечательные педагоги сумели воспитать в своих учениках по-настоящему глубокое понимание музыки,  привить детям любовь к музицированию. Они заложили ту концептуальную и методическую основу, на которую в дальнейшем стали ориентироваться их коллеги. 

В настоящее время освоение музыкально-теоретических дисциплин в СМШ отличается полнотой и разнообразием. Кроме традиционных уроков сольфеджио и музыкальной литературы дети  изучают  на уроках гармонизации основы классической гармонии; ученики, проявляющие интерес к сочинению музыки, успешно осваивают основы музыкальной композиции в классе Заслуженного деятеля  искусств УР, члена Союза композиторов РФ Черезова  Сергея Николаевича. 

Учащиеся СМШ успешно выступают на Всероссийских и  республиканских конкурсах по композиции, становятся лауреатами  и обладателями Гран-при Республиканских конкурсов по сольфеджио и музыкальной литературе, Межрегиональных музыкально-теоретических олимпиад среди учащихся ДМШ и ДШИ, Всероссийской олимпиады по сольфеджио и музыкальной литературе. С 2010 года руководит отделом музыкально-теоретических дисциплин Седельникова Вера Геннадьевна.